Foi co-fundador da empresa de consultoria CSC Index e é, juntamente com Michael Hammer, o doutrinador do fenômeno de gestão dos anos 90: a reengenharia. Graças ao livro que escreveram sobre esse tema e à popularidade do conceito, a CSC tornou-se uma das maiores empresas de consultoria do mundo.
Para James Champy e Michael Hammer, a reengenharia era mais do que melhorar os processos. Eles encaravam-na como uma receita para liderar uma revolução empresarial.
Muitos acusaram a idéia de utópica — por ser impossível «passar uma borracha» sobre o passado das empresas — e até desumana — porque ignorava a importância das pessoas, vistas como meros responsáveis por processos.
Mas o grande problema da reengenharia foi o de ser confundida com o downsizing, algo que Champy procurou remediar, sem sucesso, no livro Reengineering Management. Em 1996, Champy abandonou a CSC para liderar a consultoria da Perot Systems.